Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smad1P70340 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smad1P70340 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Smad1P70340 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smad1P70340 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smad1P70340 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smad1P70340 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smad1P70340 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smad1P70340 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Smad1P70340 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Smad1P70340 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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