Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gfi1P70338 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfi1P70338 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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