Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hoxb13P70321 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hoxb13P70321 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hoxb13P70321 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb13P70321 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxb13P70321 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxb13P70321 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxb13P70321 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxb13P70321 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Hoxb13P70321 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxb13P70321 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Hoxb13P70321 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb13P70321 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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