Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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