Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Traf5P70191 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf5P70191 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms