Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbdsP70122 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbdsP70122 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SbdsP70122 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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