Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rbx1P62878 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbx1P62878 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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