Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vbp1P61759 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Vbp1P61759 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Vbp1P61759 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Vbp1P61759 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Vbp1P61759 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Vbp1P61759 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vbp1P61759 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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