Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tpm2P58774 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm2P58774 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms