Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms