Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Samsn1P57725 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms