Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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NcstnP57716 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NcstnP57716 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NcstnP57716 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NcstnP57716 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NcstnP57716 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
NcstnP57716 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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