Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gp1bbP56400 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gp1bbP56400 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gp1bbP56400 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms