Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrp1P56183 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms