Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NcanP55066 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NcanP55066 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NcanP55066 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NcanP55066 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms