Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PctpP53808 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms