Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epb41l4aP52963 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41l4aP52963 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms