Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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