Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpbP50405 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpbP50405 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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