Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HpdP49429 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
HpdP49429 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HpdP49429 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HpdP49429 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HpdP49429 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms