Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Epb42P49222 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Epb42P49222 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Epb42P49222 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms