Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ercc3P49135 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms