Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms