Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcd1P48410 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcd1P48410 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms