Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VdrP48281 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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VdrP48281 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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VdrP48281 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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VdrP48281 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VdrP48281 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VdrP48281 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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