Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gbx2P48031 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gbx2P48031 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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