Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Myo1bP46735 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Myo1bP46735 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms