Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PtgfrP43117 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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