Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LtbP41155 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LtbP41155 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LtbP41155 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LtbP41155 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LtbP41155 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
LtbP41155 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LtbP41155 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms