Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lig1P37913 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lig1P37913 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lig1P37913 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms