Protein–RNA interactions for Protein: P36423

Tbxas1, Thromboxane-A synthase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbxas1P36423 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tbxas1P36423 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tbxas1P36423 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms