Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms