Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms