Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin1P35438 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin1P35438 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin1P35438 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms