Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptpn11P35235 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn11P35235 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms