Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rom1P32958 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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