Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms