Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctnnd1P30999 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnnd1P30999 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms