Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col2a1P28481 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col2a1P28481 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms