Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms