Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gjc1P28229 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjc1P28229 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms