Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms