Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PdgfraP26618 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PdgfraP26618 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms