Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U2af2P26369 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms