Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctnna1P26231 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms