Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PparaP23204 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PparaP23204 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms