Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Eif3aP23116 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms