Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pou3f1P21952 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms