Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fcer1aP20489 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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