Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TP20293 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TP20293 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TP20293 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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